Kinder erzählen ihren Eltern nicht alles.

Geht sie denn gerne in die Schule oder ist das Morgens eher ein Kampf, das könnte nämlich auch ein Zeichen sein.

Wieso hat denkt dein Kinderarzt, dass es etwas seelisches nicht sein kann?

Gerade dickere Kinder (ich sprech da aus Erfahrung ) brauchen in der Schule ein extrem dickes seelisches Fell, da fast alle Hänseleien ausgesetzt ist.
Wenn deine Tochter eher ein ruhiger Typ ist (war sie schon immer so oder hat sich das verändert) kann das auch zu Problemen führen, wenn nicht genug Durchsetzungsvermögen vorhanden ist.

Ruhig sein kann auch eine Art von Rückzug sein.

Ich würde noch mal gezielt deine Tochter auf Schule ansprechen, wie die Kinder mit ihr umgehen, ob sie gehänselt wird, etc.
Und ich würde sie auch fragen ob sie sich öfter traurig fühlt, gerne mehr Freunde hätte etc.

Da dies alles ein sehr schwieriges Thema ist, vor allem wenn deine Tochter dort Probleme hat, würde ich in solche Gespräche evtl. deinen Erfahrungen mit einstreuen.

Also z.B. "weißt du, als ich damals in der Schule war gab es 2 Jungs, die mich dauernd gehänselt haben, ..." (natürlich nur wenn du so etwas erlebt hast)

Das kann manchmal helfen, die Brücke zu sehr belastenden Themen zu schlagen.
Und ruhig öfter nachhaken, manchmal brauch es auch seine Zeit, bis Kinder wirklich mit der "Sprache" rausrücken.

Euer gutes Verhältnis ist für solche Gespräche auf jeden Fall ein Pluspunkt.

Wenn dabei nichts raus kommt, könntest du auch evtl. mal den Gang zu einem Gynäkologen in betracht ziehen. Vielleicht gibt es ja da ein Problem, denn mit 12 Jahren sollte deine Tochter eigentlich langsam in die Pubertät kommen.

Liebe Grüße

Michael